1、设施土壤栽培由于常年的过量施肥、不合理的灌溉方式及不科学的种植模式，导致土壤次生盐渍化严重、养分失衡、土传病害严重、作物自毒物质积累，严重影响了作物的生长发育。
2、土壤的消毒和改良的工作不仅成本高，而且效果不理想，土壤连作障碍日益严重，甚至无法继续种植。无土栽培可以从根本上解决土壤这类问题，在播种下一茬之前只需要一定的消毒措施，便可以继续种植，并且不会因连作障碍问题的出现而降低生产效益。
3、节水省肥，省工省力。无土栽培根据作物不同时期的水肥需求，定量的供给，很大程度上减少了水肥的浪费，避免了水肥的流失、土壤吸附及微生物的固定，提高水肥的利用率。
4、无土栽培的耗水量大约仅为土壤栽培的1/4～1/10，是发展节水型农业的有效措施之一，尤其是对于半干旱干旱缺水地区意义重大；土壤栽培肥料的利用率约50%，甚至更低，50%以上的养分被损失浪费，而无土栽培尤其是封闭式营养液循环栽培，肥料利用率高达90%以上。
5、无土栽培的出现，使农作物的生产不再受土壤的约束，摆脱了传统农业依靠土壤的生产模式，极大地扩展农业生产的利用空间。与一般土壤栽培相比较，无土栽培在设施园艺的结合下，根据作物的生长环境能积极合理将作物生长环境中的温光水肥气等调节到最适的程度，最大程度的发挥作物的生长潜力，作物生长速度快、长势强。