无土栽培由于其从栽培设施到环境控制都能做到根据作物生长发育的需要进行监测和调控，因而具有一般传统的土壤栽培所无法比拟的优越性，可以概括为以下面几个方面。
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1、无土栽培的作物生长快，产量高，如番茄、黄瓜等作物的产量比土壤栽培高1倍以上。
2、免除土壤污染，可以生产出清洁卫生、少污染、无公害，品质好的产品。无土栽培的作物，特别是蔬菜、瓜果等，由于不施用人粪尿，厩肥等农家肥料，病虫害相对又少，大大减少农药的使用，不喷洒除草剂，因此其产品大大地减少了肥料、农药、寄生虫、病菌及重金属等污染，清洁卫生无公害，同时，果大而整齐，颜色鲜艳，商品性和食用品质均好。
3、省工、节水、省肥。由于不需要进行土壤耕作、整地、施肥、中耕除草等，田间管理工作大大减少，不仅能节省用工，同时劳动强度亦不大，能大大改善农业生产的劳动条件，有利于省力化栽培。在人工控制下，通过营养液的科学管理来确保水分和养分的供应，因而可以大大减少了土壤栽培中水肥的渗漏、流失、挥发与蒸发，所以在沙漠干旱地区进行无土栽培亦是一项很好的“节水工程”。
4、可以避免土壤连作障害：如果土壤连作频繁，会导致土传病虫害日见增长，土壤盐类不断积聚或土壤酸化、板结等障害，已成为影响蔬菜生产发展的一个重要制约因素，而应用无土栽培则可以避免上述土壤连作障害的发生。
5、不受地区、土壤等条件的限制。可以在屋顶、阳台以及不能进行土壤栽培的地方如沙漠、油田、海涂和土壤严重污染的地区应用。