目前无土栽培肥料配方有很多种，传统的配方仅含无机盐成分，新型的配方会加入活性有机物成分，能够提高作物长势、营养价值并降低后期硝酸盐的含量
所有的无土栽培配方，都需要加入大、中、微量元素，才能真正模拟土壤溶液的成分。而中量元素里的钙，在高浓度的情况下容易与硫酸根、磷酸根离子形成沉淀，所以如果是真正的无土栽培固体或液体配方，不可能仅通过一种肥料就满足水培的需求。无土栽培肥料与普通的水溶肥还有两点非常不同。
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1、酸碱缓冲性强。植物在吸收矿质离子的过程中，会引起土壤溶液的PH值变化；无土栽培由于失去了土壤环境的酸碱缓冲性，需要在营养液的配比上更慎重，并加入缓冲物质，长期使用不会引起酸碱度的剧烈波动。
2、如果用一般的水溶肥，由于配方本身没有考虑酸碱性的变化问题，种植一段时间后很容易偏酸或偏碱，影响作物长势。
3、原料要求更高。无土栽培肥料不仅要100%溶解，而且可溶性杂质的量也要尽可能低，否则在没有土壤缓冲性的情况下，营养液的有害杂质累积很容易让植物长势变差。
4、可以这么说，无土栽培肥料能够完全代替普通的大田用水溶肥；但是普通水溶肥一般不能替代无土栽培肥料。