基质是无土栽培中重要的栽培组成材料，因此，对基质应根据具体情况予以精心选择，基质的选用原则可以从三个方面考虑，一是植物根系的适应性，二是基质的适用性，三是基质的经济性。
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1、根系的适应性：无土基质的优点之一是可以创造植物根系生长所需要的最佳环境条件，即最佳的水气比例。气生根、肉质根需要很好的通气性，同时需要保持根系周围的湿度达80%以上，粗壮根系要求湿度达80%以上，通气较好。
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2、基质的适用性：指选用的基质是否适合所要种植的作物。一般来说，基质的容重在0.5左右，总孔隙度在60%左右，大小孔隙比在0.5左右，化学稳定性强，酸碱度接近中性，没有有毒物质存在时，都是适用的。决定基质是否使用，还应该有针对性地进行栽培试验，这样可提高选择基质的准确性。
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3、基质的经济性：除了考虑基质的适应性以外，选用基质时还要考虑其经济性。有些基质虽对植物生长有良好的作用，但来源不易或价格太高，因而不宜使用。
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选用基质既要考虑对促进作物生长有良好效果，又要考虑基质来源容易，价格低廉，经济效益高，不污染环境，使用方便，可利用时间长短以及外观洁美等因素。