大雨过后，大棚积水是常见问题，这不仅影响作物的正常生长，还可能导致严重的经济损失。针对大棚积水问题，排水只是第一步，后续的管理措施同样关键。
一、积水时间不长的棚室
这类棚室浸泡时间不太长，通常排水过后植株还可正常生长。
1.及时冲施清水：如果棚室中积水浸泡时间不太长，蔬菜苗子易因根系长时间的雨水浸泡而出现沤根的情况。建议排水过后及时冲施一遍清水（不带任何肥料），为根系提供充足的氧气，减少根系的腐烂发热及死棵现象，即“涝浇园”。未铺设地膜的地块进行划锄，以利于土壤散墒及疏松土壤，划锄后可再冲一次水（或带少量肥料）。以后的管理中则要正常管理，冲施肥料。
2.防治病害：排水过后，土壤中病菌较多，土壤通透性较差，为防止植株在后面的生长过程中出现死棵现象，也可选用防治根腐病及枯萎病或软腐病的药剂进行灌根或冲施。
3.清洗叶片：如果蔬菜植株及叶片上面有较多的泥水，会影响植株进行光合作用，建议冲清水后，可用喷雾器进行清洗，覆着较多的叶片可多次连续冲洗叶片。
二、浸泡时间过长导致苗子出现死棵的棚室
如果棚室出现苗子沤根或根系生长不良（毛细根少，根系变黄变褐）或死棵现象，或植株出现叶片失水萎蔫现象，建议换苗重栽。此类植株即使还存活，但生长后期可能会出现植株死棵、病害或开花座果不良的情况，影响后期的管理。
1.深翻或晾晒土壤：苗子定植前，建议将大棚土壤进行深翻或晾晒，重新定植的植株需要泡盘或定植后灌根，可选择铜制剂加恶霉灵或甲霜灵等药剂进行病害的预防。
2.清洗和消毒基质：无土栽培的地块在换苗前冲施两遍清水清洗基质，水泡后绿苔重，需要将基质进行重新消毒（高温晾晒或药剂处理为宜）。
三、土壤肥料施用
1.少量多次施用肥料：已经定植后的大棚土壤经过两次或多次雨水浸泡后，会出现肥料随水流失的情况，土壤肥力可能会降低，为避免出现植株脱肥情况，建议少量多次施用肥料，并增加生物菌以活化土壤，同时辅以叶面追肥，保证蔬菜正常生长所需的各种营养。
2.重新施用底肥：施用底肥后准备定植的大棚，土壤经过大水浸泡后，土壤肥力不足，为保证后期植株的正常生长，建议重新施用底肥，增加有机肥的施用量，多补充生物菌，并深翻一下土壤，以保证蔬菜的正常生长。