不论采用何种类型的无土栽培，几个最基本的环节必须掌握，无土栽培时营养液必须溶解在水中，然后供给植物根系。基质栽培时，营养液浇在基质中，而后被作物根系吸收。无土栽培尤其是水培系统中，根系生长受到基质尺寸的限制，一旦营养液不能满足植株需求，作物生长就会立即受到限制。所以对水质、营养液和所用的基质的物理、化学性状，必须有所了解。
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无土栽培的水质要求比一般农田灌溉水的要求高，但可低于饮用水的水质要求。尤其是对水培，因为它不像土壤栽培具有缓冲能力，所以许多元素含量都比土壤栽培允许的浓度标准低，否则就会发生毒害，无土栽培的水，PH值不要太高或太低，因为一般作物对营养液PH的要求从中性最好，如果水质本身PH值偏高或低，就要用酸或碱进行调整，既浪费药品又费时费工。
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其次，营养液是无土栽培的关键，不同作物要求不同的营养液配方。养液配方中，差别最大的是其中氮和钾的比例。要考虑到化学试剂的纯度和成本，生产上可以使用化肥以降低成本。配置的方法是西安配出母液（原液），在进行稀释，可以节省容器便于保存。同时要现配现用，尽量避免形成沉淀。
最后，硬度是非常重要的指标，决定着营养液的配制。根据水中含有钙盐和镁盐的数量可以将水分为软水和硬水。硬水中钙镁含量高，所以在配制营养液的时候就要根据水中的钙镁含量来适当加减，避免钙镁浓度过高。硬度太高的水不适宜作为无土栽培的用水，特别是水培，通常15°以下的水用作无土栽培较为合适。
所以在无土栽培种植中，一般使用井水和自来水为主，但是河水、泉水、湖水、雨水也可用于营养液配制。无论采用何种水源，使用前都要经过分析化验以确定水质是否适宜。